Além do interesse arquitectónico do edifício, uma residência familiar de finais do século XIX de gosto eclético, o Museu alberga três tipos de colecções: mobiliário, concordante com a época da sua construção (finais do século XIX), pintura e escultura.
Enquanto no primeiro piso, o espaço nobre da casa, encontramos o mobiliário e todos os elementos decorativos que caracterizam o gosto do arquitecto e dos proprietários, condizentes também com a época, no segundo, o espaço da intimidade, encontra-se a exposição permanente (ou de longa duração, se comparada com outras mostras temporárias noutros espaços do museu) que assenta das obras da colecção de pintura da Autarquia de Matosinhos, com particular incidência em três artistas relacionados de modo estreito com Matosinhos: António Carneiro (1872-1930), notável retratista e autor de dezenas de marinhas de Leça, de feição simbolista; Agostinho Salgado (1905-1967), natural de Leça, produziu inúmeras paisagens leceiras, de cariz naturalista; Augusto Gomes (1910-1976), pintor ligado ao neo-realismo, enalteceu os usos e costumes dos pescadores de Matosinhos nas suas telas; nos jardins e no Espaço Irene Vilar (antigas cavalariças) as esculturas expostas são da autoria dos mestres Álvaro Siza, Rui Anahory, Lagoa Henriques e Irene Vilar.
O Museu conta ainda com espaços de reservas temporárias, loja, cafetaria, serviços administrativos e, no exterior, auditório e espaços oficinais e de arrecadação para os Serviços Educativos.