São órgãos do ISCPSI:
- a)A direção;
- b)A direção de ensino;
- c)O centro de investigação;
- d)O corpo de alunos;
- e)A direção dos serviços de administração;
- f)O conselho consultivo;
- g)O conselho científico;
- h)O conselho pedagógico;
- i)O conselho de disciplina; e
- j)O conselho de gestão.