Na prossecução da sua missão, são atribuições da CIAE:
- a)Proceder à análise e debate das questões estratégicas no âmbito da União Europeia e à apresentação de propostas relativas às grandes linhas de orientação delas decorrentes;
- b)Deliberar sobre as matérias onde se revele necessária a coordenação interministerial, definindo as posições negociais nacionais;
- c)Assegurar a articulação dos processos relacionados com o Semestre Europeu;
- d)Definir as posições nacionais a assumir nas diferentes sedes de negociação europeia do Quadro Financeiro Plurianual;
- e)Definir a orientação portuguesa em matéria de pré-contencioso e de contencioso da União Europeia;
- f)Coordenar e acompanhar a transposição da legislação da União Europeia para a ordem jurídica nacional;
- g)Examinar, sempre que tal se revele necessário, matérias relevantes para o relacionamento bilateral de Portugal com os Estados membros da União Europeia, países candidatos e países do Espaço Económico Europeu.