A estrutura do Governo Regional da Madeira é a seguinte:
a) Presidência do Governo;
b) Secretaria Regional dos Assuntos Parlamentares e Europeus;
c) Secretaria Regional das Finanças e da Administração Pública;
d) Secretaria Regional da Inclusão e Assuntos Sociais;
e) Secretaria Regional da Economia, Turismo e Cultura;
f) Secretaria Regional de Educação;
g) Secretaria Regional do Ambiente e Recursos Naturais;
h) Secretaria Regional da Saúde;
i) Secretaria Regional de Agricultura e Pescas.