Para a prossecução dos seus objectivos, a SRAPA dispõe dos seguintes órgãos e serviços:
- a)De carácter consultivo:
Comissão Consultiva da Agricultura, Florestas e Pescas (CCAFP);
Conselho Regional da Agricultura e Desenvolvimento Rural (CRADR);
Conselho Consultivo Florestal Regional (CCFR);
Conselho Regional das Pescas (CRP);
- b)De apoio técnico:
Gabinete de Planeamento (GP);
- c)De apoio instrumental:
Divisão Administrativa e Financeira (DAF);
- d)De natureza operativa:
Direcção Regional do Desenvolvimento Agrário (DRDA);
Direcção Regional dos Recursos Florestais (DRRF);
Direcção Regional das Pescas (DRP).