À Secretaria Central compete:
- a)Elaborar a ordem de serviço do EMGFA;
- b)Processar as guias de marcha do pessoal colocado na estrutura orgânica do EMGFA, incluindo quando destinado a cargos internacionais e às missões militares no estrangeiro, na sua apresentação e no fim da comissão de serviço;
- c)Processar as guias de marcha do pessoal que transita pelo EMGFA para o cumprimento de missões específicas;
- d)Coligir e disponibilizar a informação dos movimentos de pessoal referidos nas alíneas b) e c), de acordo com as diretivas superiores;
- e)Proceder à receção e encaminhamento da correspondência dirigida ao EMGFA, de acordo com as diretivas superiores;
- f)Proceder ao envio da correspondência do EMGFA para o exterior, de acordo com as diretivas superiores.