A organização interna da DGAL obedece ao seguinte modelo estrutural misto:
- a)Nas áreas de actividades relativas à concretização e planeamento dos programas operacionais comunitários, ao apoio e assessoria técnica especializada em matéria de relevância autárquica, à concepção e gestão de sistemas de informação com relevância na administração local, o modelo de estrutura matricial;
- b)Nas restantes áreas, o modelo de estrutura hierarquizada.