Ao Departamento de Parasitologia compete efectuar estudos no domínio das doenças parasitárias dos animais, incumbindo-lhe:
- a)Desenvolver actividades de I&D no domínio da parasitologia relacionadas com as doenças dos animais;
- b)Efectuar provas e ensaios laboratoriais subsidiários da diagnose e profilaxia das zoonoses e de outras parasitoses dos animais;
- c)Realizar análises e ensaios relacionados com o apoio laboratorial à inspecção sanitária no âmbito das suas actividades específicas;
- d)Desenvolver normas e protocolos para uniformização de metodologias a nível nacional.