A organização interna da DGPRM obedece ao seguinte modelo estrutural misto:
- a)Nas áreas relativas à gestão dos projectos para a adopção de medidas no âmbito da gestão de recursos e da organização e simplificação dos circuitos e métodos de trabalho, o modelo de estrutura matricial;
- b)Nas restantes áreas, o modelo de estrutura hierarquizada.