A gestão da UATLA é exercida nos diferentes aspectos da sua actividade segundo critérios de rigor, responsabilização e equilíbrio, tendo em conta que:
Todos os aspectos relacionados com a gestão administrativa, económica e financeira são coordenados e supervisionados pela entidade instituidora e operacionalizados pela UATLA;
O controlo de gestão será baseado num sistema de custeio por actividades;
O ensino, a investigação e a prestação de serviços à comunidade constituem as principais actividades geradoras de meios financeiros.