A FBAUP é uma Unidade Orgânica da Universidade do Porto, com órgãos de autogoverno cuja estrutura organizativa inclui os seguintes Órgãos de Gestão:
- a)Conselho de Representantes;
- b)Diretor;
- c)Conselho Executivo;
- d)Conselho Científico;
- e)Conselho Pedagógico;
- f)Órgão de Fiscalização.