O Departamento de Prospectiva e Planeamento e Relações Internacionais estrutura-se nas seguintes unidades orgânicas nucleares:
- a)Direcção de Serviços de Políticas Comunitárias e Internacionais;
- b)Direcção de Serviços de Prospectiva Estratégica;
- c)Direcção de Serviços de Desenvolvimento Sustentável e Competitividade;
- d)Direcção de Serviços de Planeamento e Gestão Estratégica;
- e)Direcção de Serviços de Informação, Gestão e Administração.