São objetivos do mestrado em Saúde Tropical:
1) Formar profissionais com conhecimentos teóricos e práticos que lhes permitam pesquisar, compilar, analisar e apresentar com rigor o estado atual do conhecimento sobre as patologias e grandes questões da Saúde e Medicina Tropical.
2) Formar profissionais com capacidade para serem investigadores e/ou integrarem equipas de investigação em Saúde e Medicina Tropical, produzindo novos conhecimentos.
3) Formar profissionais que possam participar no planeamento, execução e avaliação de aspetos concretos dos sistemas de saúde, no que diz respeito à sua vertente de Saúde e Medicina Tropical.
4) Formar profissionais que possam participar em equipas multidisciplinares e contribuir para a melhoria da saúde e dos sistemas de saúde nos seus países de origem e em países terceiros, particularmente nos países de língua oficial portuguesa.
5) Formar profissionais que possam refletir e avaliar crítica e continuadamente a sua prática profissional.