O CIEMar-ÍLHAVO tem uma natureza integrada, aliando à sua componente de centro de investigação a função aglutinadora de uma estrutura composta por quatro valências:
- a)CIEMar (unidade de investigação propriamente dita);
- b)DocMarÍlhavo;
- c)MarInfo;
- d)ForMarÍlhavo.