Compete à Direção do Museu:
- a)Fazer cumprir o presente Regulamento;
- b)Assegurar o bom funcionamento do Museu, fazendo a gestão dos recursos humanos e financeiros disponíveis;
- c)Representar tecnicamente o Museu, designadamente, em reuniões científicas e congressos;
- d)Avaliar a importância de adquirir novas coleções e ou objetos para integrarem o espólio museológico;
- e)Dar parecer sobre a importância de doações para integrarem o espólio de acordo com a missão e vocação do Museu;
- f)Avaliar a importância de ser fiel depositário de um objeto ou coleção no Museu;
- g)Promover a organização e implementação da loja do Museu;
- h)Promover a manutenção do edifício, em colaboração com outras unidades orgânicas da Câmara Municipal de Faro;
- i)Proceder regularmente à realização de uma vistoria com vista a avaliar a necessidade de obras de manutenção do edifício, tendo em conta a sua segurança bem como, das coleções;
- j)Propor e fazer cumprir o Plano Anual de Atividades do Museu e elaborar o respetivo Relatório Anual de Atividades;
- k)Zelar pelo rigor científico e a qualidade das exposições apresentadas no Museu;
- l)Propor o estabelecimento de protocolos com outras instituições para o desenvolvimento de atividades conjuntas;
- m)Elaborar a programação museológica ou de requalificação do Museu;
- n)Promover, organizar, editar e reeditar catálogos, folhetos e outro material para publicitação do Museu e propor os respetivos preços;
- o)Promover a constituição e permanente atualização de um núcleo documental - Centro de Documentação - através da aquisição de obras relacionadas com as temáticas do Museu, proporcionando condições de acesso ao público;
- p)Promover a permuta de publicações editadas pela Câmara Municipal de Faro, com publicações nacionais e estrangeiras, para enriquecimento do fundo documental do Centro de Documentação;
- q)Pronunciar-se sobre os pedidos de cedência temporária de objetos do acervo do Museu;
- r)Fazer cumprir as funções museológicas de estudo, investigação, inventário e documentação, segurança, edição, exposição e educação.