Os SMCB estruturam-se em torno das seguintes unidades orgânicas flexíveis, lideradas por um Chefe de Divisão:
- a)Divisão Administrativa e Financeira (DAF);
- b)Divisão Comercial e de Modernização Administrativa (DCMA);
- c)Divisão Técnica de Serviços de Águas (DTSA);
- d)Divisão de Recolha e Valorização de Resíduos Urbanos (DRVRU).