A mobilidade de estudantes, docentes, investigadores e colaboradores constitui um instrumento essencial para a internacionalização do ensino superior e para a construção de comunidades académicas globais. A Egas Moniz detém a Erasmus Charter for Higher Education (ECHE) para o período 2021-2027, concedida pela Comissão Europeia, e é membro da EURASHE, reafirmando o seu compromisso com os valores europeus de mobilidade, qualidade e cooperação académica.
A instituição incentiva a participação em programas de mobilidade Erasmus+ e noutras iniciativas internacionais de formação, investigação e cooperação científica, nomeadamente com as universidades e centros de investigação com os quais mantém parcerias ativas em França, Brasil, Espanha, Alemanha, Reino Unido e outros países.