A Marinha é comandada pelo CEMA e, para o cumprimento da respetiva missão, compreende:
- a)O Estado-Maior da Armada (EMA);
- b)Os órgãos centrais de administração e direção;
- c)O comando de componente naval, designado por Comando Naval (CN);
- d)Os órgãos de conselho;
- e)O órgão de inspeção, designado por Inspeção-Geral da Marinha (IGM);
- f)Os órgãos de base;
- g)Os elementos da componente operacional do sistema de forças;
- h)Os órgãos e serviços regulados por legislação própria.