A organização interna da ETF obedece ao seguinte modelo estrutural misto:
- a)O modelo estrutural matricial, nas seguintes áreas:
- i)Estudo, implementação, desenvolvimento e acompanhamento de projetos;
- ii)Função acionista das empresas do setor empresarial do Estado;
- iii)Atividade da UTAP;
- b)O modelo de estrutura hierarquizada, nas restantes áreas.