Para a prossecução dos seus objetivos a SRRN dispõe dos seguintes órgãos e serviços:
a) Consultivos:
i. Conselho Regional da Agricultura, Florestas e Desenvolvimento Rural;
ii. Conselho Regional do Ambiente e do Desenvolvimento Sustentável;
iii. Conselho Regional das Pescas;
iv. Comissão Interdepartamental para os Assuntos do Mar.
b) Executivos Centrais:
i. Direção Regional da Agricultura e Desenvolvimento Rural;
ii. Direção Regional dos Recursos Florestais;
iii. Direção Regional do Ambiente;
iv. Direção Regional das Pescas;
v. Direção Regional dos Assuntos do Mar;
vi. Gabinete de Planeamento.
c) Executivos Periféricos:
i. Serviços de Desenvolvimento Agrário de Ilha;
ii. Serviços Florestais de Ilha;
iii. Serviços de Ambiente de Ilha;
iv. Gabinete Técnico da Paisagem da Cultura da Vinha da ilha do Pico.
d) De inspeção, auditoria e fiscalização:
i. Inspeção Regional das Pescas;
ii. Inspeção Regional do Ambiente.
e) Entidades Reguladoras:
i. Entidade Reguladora dos Serviços de Águas e Resíduos dos Açores.