A estrutura do Governo Regional da Madeira é a seguinte:
a) Presidência do Governo;
b) Vice-Presidência do Governo;
c) Secretaria Regional dos Recursos Humanos;
d) Secretaria Regional do Turismo e Cultura;
e) Secretaria Regional do Equipamento Social e Transportes;
f) Secretaria Regional dos Assuntos Sociais;
g) Secretaria Regional de Educação;
h) Secretaria Regional do Plano e Finanças;
i) Secretaria Regional do Ambiente e dos Recursos Naturais.