A SRTC é superiormente dirigida pelo Secretário Regional do Turismo e Cultura e tem a seguinte estrutura orgânica:
- a)Gabinete do Secretário Regional (GSR);
- b)Conselho Regional do Turismo (CRT);
- c)Gabinete Jurídico (GJ);
- d)Divisão dos Serviços Administrativos (DSA);
- e)Direcção Regional do Turismo (DRT);
- f)Direcção Regional dos Assuntos Culturais (DRAC);
- g)Escola de Hotelaria e Turismo da Madeira (EHTM);
- h)Centro de Estudos de História do Atlântico (CEHA).