São serviços da sede do LNIV em Lisboa:
1) Departamentos:
- a)Departamento de Patologia;
- b)Departamento de Bacteriologia;
- c)Departamento de Virologia;
- d)Departamento de Parasitologia;
- e)Departamento de Biologia Celular;
- f)Departamento de Produtos Biológicos e Quimioterapêuticos;
- g)Departamento de Higiene Pública;
2) Unidades:
- a)Unidade de Preparação de Meios de Cultura e de Reagentes Analíticos;
- b)Unidade de Criação, Selecção e Bem-Estar dos Animais de Experiência;
3) Direcções de serviço:
- a)Gabinete de Garantia da Qualidade;
- b)Gabinete de Planeamento;
- c)Direcção de Serviços de Administração.