À Secção de Contabilidade compete:
- a)Conferir, classificar e processar os documentos de receita e de despesa;
- b)Proceder à contabilização dos documentos de receita e despesa;
- c)Escriturar, de acordo com a legislação vigente, os livros de contabilidade;
- d)Controlar o movimento de tesouraria, elaborando um balanço mensal para o submeter à apreciação do conselho administrativo;
- e)Implementar sistemas de contabilidade analítica, como suporte à gestão financeira de projectos específicos de investigação e desenvolvimento.