A estrutura dirigente da FMUL tem a seguinte composição:
- a)Diretor Executivo, equiparado para efeitos remuneratórios a cargo de direção superior de 2.º grau;
- b)Diretor de Serviços, equiparado para efeitos remuneratórios a cargo de direção intermédia de 1.º grau
- i)Direção de Serviços de Gestão Administrativa e Área de Instalações, Equipamentos, Aprovisionamento e de Tecnologias de Informação
- c)Coordenadores de Área, equiparados para efeitos remuneratórios a cargo de direção intermédia de 2.º grau
- i)Área de Recursos Humanos e Vencimentos;
- ii)Área de Gestão Financeira e Patrimonial;
- iii)Área Académica;
- iv)Área dos Polos Administrativos;
- v)Área de Biblioteca e Informação.
- vi)Área de Apoio aos Órgãos de Governo;
- vii)Área de Pós-Graduação - Instituto de Formação Avançada
- d)Coordenadores de Gabinete ou Núcleo, equiparados para efeitos remuneratórios a cargo de direção intermédia de 3.º grau, a que corresponde a remuneração base mensal de 60 % do padrão fixado para o cargo de Diretor-Geral
- i)Gabinete de Planeamento Estratégico e Qualidade
- ii)Gabinete Técnico - Edificado e Sustentabilidade;
- iii)Núcleo Académico;
- iv)Gabinete de Assessoria Organizacional.
- e)Coordenadores de Serviço, equiparados para efeitos remuneratórios a cargo de direção intermédia de 4.º grau, a que corresponde a remuneração base mensal de 50 % do padrão fixado para o cargo de Diretor-Geral.