A ESTeSC organiza-se na seguinte divisão de órgãos, unidades e serviços, identificados pelos objetivos que prosseguem e pelas funções que desempenham:
- a)Órgãos de Governo e de Gestão;
- b)Departamentos;
- c)Unidades Científico-Pedagógicas;
- d)Unidade de Formação Avançada;
- e)Unidade de Investigação Aplicada;
- f)Unidade de Prestação de Serviços;
- g)Serviços de Apoio.