O Gabinete de Planeamento e Apoio à Investigação é chefiado por um oficial com o posto de capitão-de-fragata ou tenente-coronel indigitado pelos ramos das Forças Armadas ou pela GNR e nomeado pelo comandante do IUM em regime de rotatividade, ao qual compete designadamente:
- a)Propor e coordenar a execução do planeamento da investigação científica no IUM;
- b)Apoiar os investigadores do IUM, incluindo os das UOA, no desenvolvimento do respetivo trabalho, através da criação de condições favoráveis ao seu eficiente progresso.