A Secção de Secretariado é chefiada por um sargento, indigitado pelos ramos das Forças Armadas ou pela GNR e nomeado pelo comandante do IUM, em regime de rotatividade, ao qual compete designadamente:
- a)Prestar todo o apoio de secretariado necessário ao desenvolvimento das atividades do CIDIUM;
- b)Prestar o apoio de secretariado aos trabalhos de coordenação e investigação desenvolvidos no âmbito do CIDIUM.