São os seguintes os órgãos do ITQB NOVA:
- a)O Conselho de Instituto;
- b)O Diretor;
- c)O Conselho de Gestão;
- d)O Conselho Científico;
- e)O Conselho Pedagógico;
- f)O Conselho de Desenvolvimento Institucional (Institutional Development Board, em inglês);
- g)O Provedor.