São órgãos da FML:
1) Órgãos de gestão global:
- a)Assembleia de representantes;
- b)Conselho directivo;
- c)Director;
2) Órgãos de gestão científica - conselho científico;
3) Órgãos de gestão pedagógica - conselho pedagógico;
4) Órgãos administrativos - conselho administrativo.