Compete ao conselho científico:
- a)Debater o estado da arte e o desenvolvimento das atividades científicas e tecnológicas nas áreas de competência do Okeanos;
- b)Apresentar propostas sobre as linhas de investigação que o Okeanos deve prosseguir;
- c)Emitir pareceres sobre todos os assuntos que lhe sejam submetidos pelo diretor ou pela Comissão Coordenadora Científica.