A estrutura flexível do Município de Óbidos, de natureza hierarquizada, compreende:
1) Sete unidades orgânicas flexíveis - divisões:
- a)Divisão Administrativa e Jurídica (DAJ);
- b)Divisão Financeira (DF);
- c)Divisão de Educação (DE);
- d)Divisão de Planeamento e Gestão Urbanística (DPGU);
- e)Divisão de Obras e Equipamentos Municipais (DOEM);
- f)Divisão de Governança (DG);
- g)Divisão de Coesão Territorial (DCT).
2) Cinco estruturas flexíveis - Subdivisões:
- a)Subdivisão de Desporto, Saúde e Bem-Estar (SDDSBE), integrada na Divisão Coesão Territorial (DCT);
- b)Subdivisão de Cultura e Turismo (SDCT), integrada na Divisão de Coesão Territorial (DCT);
- c)Subdivisão de Coesão Social (SDCS), integrada na Divisão de Coesão Territorial (DCT);
- d)Subdivisão de Sustentabilidade (SDS), integrada na Divisão de Obras e Equipamentos Municipais (DOEM);
- e)Subdivisão de Logística Municipal (SDLM) integrada na Divisão de Obras e Equipamentos Municipais (DOEM).
3) Oito subunidades orgânicas flexíveis - Secções:
- a)Secção de Contabilidade (SC);
- b)Secção Administrativa Central e Espaço do Cidadão (SAC/EDC);
- c)Secção de Recursos Humanos (SRH);
- d)Secção de Contratação Pública (SCP);
- e)Secção de Loteamentos e Obras Particulares (SLOP);
- f)Secção Administrativa de Águas e Saneamento (SAAS);
- g)Secção de Execuções Fiscais (SEF);
- h)Secção Administrativa e Financeira (SAF).