O Município de Matosinhos estrutura-se em torno de unidades orgânicas nucleares, composta por Direções Municipais e Departamentos Municipais. Ao nível das Direções Municipais e respetivos Departamentos incluem-se:
- a)A Direção Municipal de Projetos Especiais e Investimento;
- b)A Direção Municipal de Serviços Partilhados, que integra o Departamento de Sistemas de Informação, o Departamento Jurídico, o Departamento de Recursos Humanos e o Departamento Financeiro;
- c)A Direção Municipal de Obras, Ambiente e Conservação, que integra o Departamento de Conservação e o Departamento Ambiental;
- d)A Direção Municipal de Gestão do Território, que integra o Departamento de Planeamento e o Departamento de Urbanismo;
- e)O Gabinete de Segurança e Proteção Civil, que é equiparado para todos os efeitos legais a Direção Municipal, que integra o Departamento de Polícia Municipal e Fiscalização e o Departamento de Proteção Civil;
- f)O Departamento de Cultura;
- g)O Departamento de Intervenção Social;