À Direção de Inovação Pedagógica e Acompanhamento de Estudantes compete promover formação e divulgação de estratégias que promovam a melhoria da qualidade do ensino e aprendizagem, assim como acompanhar o percurso académico de estudantes, apoiar a sua integração no mercado de trabalho e promover a rede Alumni, compete ainda prestar apoio à tomada de decisão superior, bem como divulgar a informação relevante e assegurar o reporte aos organismos oficiais em matérias da sua área de atuação.
C.1 - Ao Gabinete de Inovação Pedagógica compete promover formação e divulgação de estratégias inovadoras, fomentar dinâmicas que potenciem o desenvolvimento académico de estudantes e o desenvolvimento profissional de docentes e investigadores de CIÊNCIAS ULisboa, promovendo a melhoria da qualidade do ensino e aprendizagem.
C.2 - Ao Gabinete de Acreditação compete gerir os processos de acreditação e avaliação dos ciclos de estudos conferentes de grau.
C.3 - Ao Gabinete de Acompanhamento de Estudantes compete acompanhar o percurso académico de estudantes de CIÊNCIAS ULisboa, potenciando o sucesso escolar, assim como apoiar a sua integração no mercado de trabalho e promover a rede Alumni.
C.3.1 - Ao Núcleo de Apoio ao Estudante compete promover a integração e o acompanhamento de estudantes, contribuindo para a resolução de problemas que afetem a sua aprendizagem ou o sucesso escolar.
C.3.2 - Ao Núcleo de Empregabilidade, Desenvolvimento de Carreira e Alumni compete assegurar a ligação entre estudantes e diplomados de CIÊNCIAS ULisboa e o mercado de trabalho, de modo a promover a sua inserção profissional, fazer o acompanhamento dos seus percursos profissionais e desenvolver atividades que reforcem a relação de CIÊNCIAS ULisboa com os seus antigos estudantes (alumni) e com potenciais empregadores.