O Hospital de São José compreende os seguintes órgãos:
- a)De administração:
Conselho de administração;
Presidente do conselho de administração ou director;
Administrador-delegado;
- b)De direcção técnica:
Director clínico;
Enfermeiro director de serviço de enfermagem;
- c)De apoio técnico:
Conselho técnico;
Comissão médica;
Comissão de enfermagem;
Comissão de farmácia e terapêutica;
Comissão de administração hospitalar;
Direcção do internato médico;
Comissão de higiene hospitalar;
Comissão de ética médica;
Comissão de ensino e investigação;
Comissão técnica de utilização hospitalar;
Comissão de coordenação oncológica;
- d)De participação e consulta:
Conselho geral.
- e)De fiscalização:
Auditor.