São competências da Unidade de Auditoria Interna, designadamente:
- a)Avaliar a adequação, eficiência e eficácia dos sistemas de controlo interno existentes no IGFPJ;
- b)Verificar a conformidade das actividades prosseguidas pelos serviços do IGFPJ com os objectivos, os planos, as normas internas e a legislação aplicável;
- c)Verificar a fiabilidade e a qualidade da informação recolhida, tratada, produzida ou divulgada pelo IGFPJ;
- d)Avaliar a aplicação dos recursos financeiros administrados pelo IGFPJ;
- e)Formular propostas de medidas de aperfeiçoamento e desenvolvimento dos sistemas e procedimentos operacionais, contabilísticos e de controlo interno;
- f)Orientar a preparação e assegurar a prestação de informação às entidades de controlo interno e externo.