O Gabinete de Estatística e Planeamento da Educação, abreviadamente designado por GEPE, estrutura-se nas seguintes unidades orgânicas nucleares:
- a)Direcção de Serviços de Estatística;
- b)Direcção de Serviços de Estudos, Planeamento e Avaliação;
- c)Direcção de Serviços de Relações Internacionais;
- d)Direcção de Serviços de Sistemas de Informação e Monitorização;
- e)Direcção de Serviços de Administração Geral.