Ao Núcleo de Estuários e Zonas Costeiras cabe realizar estudos nos seguintes domínios:
- a)Hidrodinâmica, transporte de sedimentos e qualidade da água de estuários, lagoas costeiras, praias e meio litoral, incluindo a avaliação de impactes ambientais induzidos por obras;
- b)Gestão das zonas costeiras com base em indicadores de qualidade ambiental e no desenvolvimento de modelos.