O ML-A disponibiliza ao público três tipos de exposições, designadamente, exposições de longa duração, temporárias e itinerantes:
1.º As exposições de longa duração, ou exposições âncora, exibem aspetos idiossincráticos da identidade local e/ou regional, bem como da expressão artística contemporânea. Alojam exposições com algumas destas características os seguintes núcleos museológicos:
- a)O convento de Santo António onde se inserem os núcleos da Memória do Concelho e do Presépio.
- b)A Casa da Cultura Carlos César que recebe a coleção de arte da Câmara Municipal de Lagoa.
- c)A Casa do Romeiro que aloja o núcleo museológico do Romeiro.
- d)O núcleo museológico do Cabouco que disponibiliza ao público a memória dos antigos ofícios.
- e)A Mercearia Central - Casa Tradicional que evoca vivências comerciais e domésticas do século passado.
- f)Outros núcleos não tutelados pela autarquia que se enquadrem no princípio.
2.º As exposições temporárias abrangem temática variada e exibir-se-ão nos seguintes espaços:
- a)No salão e nas duas galerias claustrais do piso superior do convento de Santo António.
- b)Na sala de exposições temporárias da Casa da Cultura, espaço onde assumirão, em regra, uma temática concelhia.