O IEA, em harmonia com o modelo organizacional estabelecido nos Estatutos, tem como missão assumir a coordenação das atividades de Ensino da Universidade, incluindo a inovação curricular e pedagógica, a nível do primeiro e segundo ciclos, cursos pós-secundários e cursos não conferentes de grau, interna e externamente, competindo-lhe, ainda, nesse âmbito realizar atividades, emitir pareceres e formular propostas a submeter aos órgãos competentes, designadamente sobre a qualidade e inovação curricular e pedagógica e admissão e experiência dos estudantes.