Não têm dependência direta dos departamentos as seguintes unidades orgânicas flexíveis:
1) Divisão de Desenvolvimento Estratégico (DDE), com os seguintes gabinetes na sua dependência:
- a)Gabinete de Planeamento Estratégico (GPE);
- b)Gabinete de Desenvolvimento Económico e Turismo (GDET);
- c)Gabinete de Candidaturas e Fundos Europeus (GCFE);
- d)Gabinete Seixal Sustentável e Inovação (GSSI);
- e)Gabinete Seixal Saudável (GSS);
2) Divisão de Habitação (DH);
3) Divisão de Desenvolvimento Social e Cidadania (DDSC);
4) Divisão de Comunicação e Imagem (DCI), com o seguinte gabinete na sua dependência:
- a)Gabinete de Promoção de Eventos Municipais (GPE);
5) Divisão de Fiscalização Municipal (DFM);
6) Divisão Jurídica (DJ);
7) Gabinete de Segurança Alimentar e Bem-Estar Animal (GSAA);
8) Serviço Municipal de Proteção Civil (SMPC);
9) Gabinete da Juventude (GJ);
10) Gabinete de Controlo de Gestão (GCG);
11) Gabinete de Controlo Interno, Qualidade e Auditoria (GCIQA);
12) Gabinete de Protocolo e Relações Públicas (GPRP).