O Museu de Arqueologia e Etnografia de Elvas António Tomás Pires, atualmente instalado no antigo edifício da Manutenção Militar de Elvas, foi fundado em 1880, na sequência de uma proposta apresentada em reunião de câmara a 22 de junho desse ano, que visava a criação de uma Secção de Arqueologia e Numismática no edifício da Biblioteca Municipal de Elvas, inaugurada a 10 de junho. Esta secção tinha como objetivo conservar objetos históricos descobertos ou dispersos pelo concelho, assumindo desde então um papel essencial na salvaguarda do património cultural local.
A 19 de agosto de 1919, esta secção passou a designar-se Museu Arqueológico e Etnográfico António Tomás Pires, em homenagem à relevante atividade desenvolvida por António Tomás Pires em prol da salvaguarda do património cultural do concelho de Elvas. Em 2004, na sequência da integração da Biblioteca Municipal na Rede Nacional de Bibliotecas Públicas, o Museu foi encerrado ao público, ficando as suas coleções salvaguardadas em reserva museológica. A 1 de junho de 2021, o Museu reabriu ao público num edifício reabilitado e devidamente adaptado à sua função, reafirmando a sua missão de preservar, estudar e divulgar o património arqueológico e etnográfico do concelho de Elvas.