A CE do IHMT tem reuniões ordinárias com periodicidade mensal, salvo se houver motivos que aconselhem periodicidade diversa ou a realização de reuniões extraordinárias convocadas pelo seu presidente. A CE pode reunir com a presença de uma maioria dos seus membros.
As deliberações são tomadas em princípio por consenso e, quando tal não seja possível, por maioria. Neste caso, se houver empate de votos, o presidente tem voto de qualidade.
No fim de cada ano civil, a CE deve elaborar um relatório sobre a sua actividade, o qual deve ser enviado ao director do IHMT.