O CBA é composto por áreas distintas, interligadas entre si, nomeadamente:
- a)Canil e gatil:
Canil e Gatil interior;
Parque de Recreio interior;
Parque de Recreio exterior;
- b)Zona de Higiene - Espaço destinado à higiene dos animais alojados no CBA, nomeadamente banhos e tosquias;
- c)Zona de Quarentena/ Sequestro sanitário - zona constituída por duas jaulas semicirculares, obrigatórias e indicadas para este efeito;
- d)Zona de Armazenamento de cadáveres;
- e)Sala de occisão/eutanásia, necrópsia e crematório;
- f)Zonas comuns de apoio - armazenamento de rações, materiais e equipamentos para animais, bem como de outros materiais e equipamentos de apoio ao CBA, nomeadamente produtos de limpeza e de desinfeção;
- g)Bloco operatório/Sala de recobro;
- h)Maternidade/Internamentos/enfermaria;
- i)Farmácia;
- j)Vestiários e Instalações Sanitárias;
- k)Gabinete Médico-Veterinário;
- l)Consultório e atendimento ao público;
- m)Receção e Sala de espera.