A estrutura flexível dos SMS é constituída pelas seguintes unidades e subunidades orgânicas:
- 1 -Na dependência do Departamento Financeiro (DFIN):
- 1.1 -Serviço de Contabilidade e Tesouraria (SCT)
- 1.2 -Serviço de Compras, Contratação Pública e Património (SCCPP)
- 1.2.1 -Setor de Armazém e Gestão de Stocks (SAGS)
- 1.3 -Área de Gestão Documental (AGD)
- 2 -Na dependência do Departamento Comercial (DCOM):
- 2.1 -Serviço de Gestão de Contratos e Faturação (SGCF)
- 2.2 -Serviço de Cobranças e Serviços (SCS)
- 2.3 -Gabinete de Gestão do Atendimento (GGA)
- 3 -Na dependência do Departamento de Engenharia (DENG):
- 3.1 -Serviço de Empreitadas e Fiscalização de Obras (SEFO)
- 3.2 -Serviço de Estudos, Projetos e Informação Geográfica (SEPIG)
- 3.3 -Gabinete de Modelação e Gestão de Redes (GMGR)
- 3.4 -Área de Apoio Técnico e Administrativo (AATA)
- 4 -Na dependência do Departamento de Exploração (DEXP):
- 4.1 -Divisão de Operação e Manutenção (DOM):
- 4.1.1 -Setor de Operação e Manutenção de Instalações (SOMI)
- 4.1.2 -Setor de Energia e Manutenção de Equipamentos (SEME)
- 4.2 -Divisão de Gestão de Redes (DGR):
- 4.2.1 -Serviço de Gestão das Redes de Drenagem (SGRD)
- 4.2.2 -Setor de Gestão da Rede de Abastecimento de Água (SGRA)
- 4.3 -Gabinete de Qualidade da Água e Ambiente (GQAA)
- 4.4 -Área de Apoio Técnico e Administrativo (AATA)
- 5 -Na dependência do Departamento de Resíduos Urbanos (DRU):
- 5.1 -Divisão de Gestão de Operações (DGO)
- 5.2 -Divisão de Gestão da Frota (DGF)
- 5.3 -Serviço de Estudos e Planeamento e Gestão da Informação (DEPGI)
- 5.4 -Área de Apoio Administrativo (AAA)
- 6 -Na dependência do Departamento de Recursos Humanos (DRH):
- 6.1 -Gabinete de Gestão e Planeamento de Recursos Humanos (GGPRH)
- 6.2 -Gabinete de Desenvolvimento de Competências e de Promoção da Saúde no Trabalho (GDCPST)
- 7 -Na dependência do Diretor Delegado (DD):
- 7.1 -Área de Suporte (AS)
- 7.2 -Área de Estratégia e Sustentabilidade (AES)