No âmbito do MEE funcionam ainda:
- a)O Conselho Nacional para o Empreendedorismo e a Inovação;
- b)A Comissão de Avaliação e Acompanhamento de Projectos de Interesse Nacional;
- c)A Comissão para a Igualdade no Trabalho e no Emprego;
- d)O Gabinete de Prevenção e Investigação de Acidentes com Aeronaves;
- e)O Gabinete de Investigação de Segurança e de Acidentes Ferroviários;
- f)O Centro de Relações Laborais.