Para a prossecução das suas atribuições, os SSMJ dispõem dos seguintes serviços:
- a)A Direcção de Recursos Humanos e Financeiros;
- b)A Direcção de Saúde e Acção Social;
- c)O Gabinete de Organização, Planeamento e Auditoria;
- d)O Núcleo de Sistemas de Informação.