Para elaboração de estudos e trabalhos técnicos, apoio administrativo e controlo da documentação, quer nacional, quer OTAN, dispõe o CNPCE de serviços de apoio, dirigidos pelo vice-presidente, constituídos por:
- a)Núcleo de Estudos e Planeamento;
- b)Secção Administrativa;
- c)Núcleo de Segurança;
- d)Sub-Registo OTAN.