São atribuições do Instituto:
- a)Contribuir para a correcta gestão dos recursos financeiros do Serviço Nacional de Saúde;
- b)Desenvolver sistemas de informação nos serviços do Ministério da Saúde;
- c)Contribuir para a racionalização do sistema de aquisições de bens e serviços no âmbito do Ministério da Saúde;
- d)Contribuir para a melhoria dos sistemas de organização e gestão das instituições e serviços integrados no Serviço Nacional de Saúde;
- e)Proceder à avaliação da gestão económico-financeira das instituições e serviços integrados no Serviço Nacional de Saúde ou por ele financiados.