O conselho científico é o órgão consultivo da Comissão em matéria científica, ao qual compete:
- a)Pronunciar-se sobre assuntos relacionados com os objectivos da Comissão que requeiram parecer de nível científico;
- b)Analisar as perspectivas de investigação e ensino da história militar a nível nacional e sugerir pistas para o seu incremento;
- c)Realizar sessões de apresentação de comunicações dos seus membros ou de convidados.